Отборочный этап проходил среди боевых пловцов-подводников в пункте базирования кораблей Каспийской флотилии в порту Махачкала. Отборы на конкурс «Глубина-2016» приняли участие около 100 военнослужащих и 10 единиц катеров и спецтехники. Лучших пловцов определяли в нескольких дисциплинах: плавание в ластах, преодоление дистанций с применением подводного средства передвижения, борьба «Акватлон», подводные стрельбы и многое другое. В ходе «Акватлона» кандидат должен был преодолеть подводный тоннель и в определенное время не пропустить условного противника через него. Затем боец проводил поединок уже на поверхности воды. Здесь главная задача – сорвать ленту с ноги противника. Вместе с тем, военнослужащими подводно-противодиверсионного отряда отрабатывались задачи по оказанию медпомощи тонущему товарищу. Для это применялся специальный барокомплекс (подводная медицина). По итогам отборочных мероприятий были выбраны лучшие боевые пловцы, которые войдут в состав команды Каспийской флотилии для участия в отборочном этапе ВМФ РФ.